Analcancer föregås av en cellförändring som oftast är associerad med HPV, humant papillomvirus. Viruset sprids huvudsakligen vid sexuell kontakt, tex samlag, oralsex eller petting. De flesta som haft sex har någon gång drabbats av en HPV-infektion. Hos ungefär 90% läker HPV infektionen ut med hjälp av kroppens immunförsvar men ibland kan den leda till kondylom eller allvarligare problem såsom cellförändringar som om de inte upptäcks i tid kan utvecklas till cancer.
Risken för att utveckla analcancer är låg i den allmänna befolkningen men det finns riskgrupper där forskning har visat en ökad risk. HIV-positiva personer, män som har sex med män (MSM), kvinnor med HPV-relaterade förstadier till cancer/gynekologisk cancer, personer som är immunsupprimerade på grund av sjukdom eller transplanterade och vissa autoimmuna sjukdomar.